Ο Παναθηναϊκός ολοκλήρωσε με επιτυχία την πορεία του στα προκριματικά, δίνοντας έξι αγώνες και περνώντας τρεις προκριματικούς γύρους για να εξασφαλίσει μια θέση στη League Phase του Conference League για τη σεζόν 2026-2027. Η πρόκριση κρίθηκε οριστικά εκτός έδρας απέναντι στη Χραντετς Κράλοβε, έπειτα από σχεδόν 130 αγωνιστικά λεπτά, με τον Σίριλ Ντέσερς να σκοράρει το καθοριστικό γκολ υπό τις οδηγίες του προπονητή Τζέικομπ Νίστρουπ.
Η UEFA έδωσε στη δημοσιότητα το πλήρες καλεντάρι των έξι αγωνιστικών για τον ενιαίο όμιλο των 36 ομάδων, με τον Παναθηναϊκό να αρχίζει και να τελειώνει τις υποχρεώσεις του στην έδρα του. Η πρεμιέρα των Πράσινων θα πραγματοποιηθεί στο Ολυμπιακό Στάδιο στις 15 Οκτωβρίου και ώρα 19:45, με αντίπαλο την Μπόρατς Μπάνια Λούκα. Στη συνέχεια, στις 22 Οκτωβρίου και ώρα 17:30, η ομάδα θα μεταβεί στο Καζακστάν για να αντιμετωπίσει την Καϊράτ Αλμάτι στο πλαίσιο της δεύτερης αγωνιστικής, με το παιχνίδι να αρχίζει νωρίς το απόγευμα.
Οι ευρωπαϊκές υποχρεώσεις θα συνεχιστούν στις 5 Νοεμβρίου στις 22:00 με εντός έδρας αναμέτρηση κόντρα στην ΤΣΣΚΑ Σόφιας. Ακολούθως, το πρόγραμμα περιλαμβάνει δύο διαδοχικά εκτός έδρας παιχνίδια, αρχικά απέναντι τη Νόρτζελαντ στις 26 Νοεμβρίου στις 22:00 και έπειτα κόντρα στη Φράιμπουργκ στη Γερμανία στις 10 Δεκεμβρίου στις 19:45.
Η αυλαία της φάσης των ομίλων θα πέσει στις 17 Δεκεμβρίου στις 22:00, οπότε και ο Παναθηναϊκός θα υποδεχθεί την Μπράιτον στο ΟΑΚΑ. Σημειώνεται ότι όλες οι ευρωπαϊκές αναμετρήσεις της ομάδας θα μεταδοθούν τηλεοπτικά από την COSMOTE TV, ενώ παράλληλα το ελεύθερο κανάλι του ΑΝΤ1 διατηρεί τα δικαιώματα για την πρώτη επιλογή αγώνα από κάθε αγωνιστική.